Страны и деревни настолько сильны во многом благодаря кланам, которые населяют их. Во всем мире уникальные техники передаются от поколения к поколению. Одни техники передаются генетически, другие - известны только тем, кто принадлежит клану.
Клан Абураме
Этот клан из Деревни Коноха известен способностью упралять насекомыми. При рождении члены клана разрешают жукам жить в их теле и питатся чакрой. Взамен жуки дают возможность управлять ими.
Клан Акимичи
Этот клан из Деревни Конохи известен способностью изменять размер своего тела, увеличивая вес и превращаясь в шар. В этой форме сложно получить физический урон. Также они могут изменять размер отдельных частей тела, например, рук для нанесения более сильных повреждений опоненту. Также известны своими исследованиями в медицине.
Клан Яманака
Клан Яманака Деревни Коноха известен своей техникой контроля разума. Они способны переносить свое сознание в сознание противника, тем самым беря под контроль его тело. Однако в этой технике есть недостатки: во-первых, если тело оппонента пострадает, то страдает и тело Яманаки, во-вторых, на то, чтобы вернуться обратно в свое сознание, требуется время.
Клан Инузука
Этот клан из Деревни Коноха известен связями с собаками. Каждый член клана имеет собак (одну или несколько), которые выступают партнерами и помогают в бою. Также члены клана могут использовать техники, чтобы получить способности подобные собакам.
Клан Камизуру
Также, как и клан Абураме, они управляют насекомыми, но в отличие от первых, не жуками, а пчелами. В предыдущие годы клан Камизуру был очень влиятельным в Скрытом Камне. Во время войны они возглавили нападение на Коноху. На подходе к деревне их встретил клан Абураме. Тысячи погибли в том сражении, но победу одержал клан Абураме. Для клана Камизуру настали тяжелые времена. Спустя годы Джибачи, Куробачи и Сузумебачи отправляются в долину Бикочю, чтобы найти легендарного жука Бикочу. Это помогло бы им восстановить свое имя. Три члена клана надеялись использовать этого жука, чтобы определить месторасположение запрещенного свитка, содержащего секретные техники использования жуков. С его помощью они смогли бы использовать техники более высокого уровня и выполнять более сложные задания. В результате они получили бы более высокое положение в деревне и восстановили былое величие клана.
Клан Нара
Этот клан из Деревни Коноха известен способностью управлять своей тенью. Используя эту способность представитель клана может захватить тень противника, тем самым взяв его под контроль. В таком состоянии цель повторяет все движения оппонента. Также имеют ряд других техник, основанных на управлении тенями, такие как теневые иглы или удушье тенью.
Клан Хьюга
Этот клан из Деревни Листа известен способностью видеть потоки чакры внутри организма противника. Используя эту способность с другими техниками своего клана они могут перекрывать потоки чакры, лишая противника возможности использовать чакру для выполнения техник. Семья клана делится на две ветви – главную и побочную. Членам побочной ветви делается особая татуировка на лбу, при помощи которой над ними обретаеют контроль члены главной ветви. Обязанность побочных – защищать главную ветвь.
Клан Учиха
Этот клан из Деревни Коноха известен способностью копировать чужие техники и затем воспроизводить их по своему желанию. Члены клана имеют способность изменить свои глаза, чтобы принять форму шарингана. Такими глазами они могут копировать движения тех, на кого смотрят. Это позволяет предугадывать действия противника. Также известны использованием техник огня.К сожалению, на данный момент большинство членов клана убито их же соклановцем Итачи.